Viện Viện Công nghệ Sinh học và Công nghệ Thực phẩm hiện có mối quan hệ hợp tác với nhiều Viện Nghiên cứu và trường Đại học quốc tế như:
- Trường Đại học Kyushu – Nhật Bản
- Trường Đại học Chonnam – Hàn Quốc
- Đại học Missouri – Hoa Kỳ
- Trường Đại học Bình Đông – Đài Loan
- Trường Đại học Mae Fah Luang – Thái Lan
- Học viện Hồng Hà – Trung Quốc